大道至簡 MS建模教程三步法

第一步：創建工程

（1）雙擊圖標??? 啟動Accelrys Materials Studio，出現一個歡迎界面Welcome to Material Studio，選擇Create a new proj（創建一個新工程）。

（2）點擊確定，選擇新工程保存路徑，自行命名，點擊OK。

注意：新工程可保存在任意硬盤，但是必須保證文件路徑為全英文，若存在中文字符，則會出現以下錯誤（如圖1）。

圖1. 錯誤提示信息

第二步：建立分子模型

法一：從數據庫中導入分子（以苯為例）。

（1）選擇File> Import> structures> organics > benzene導入苯分子結構。

（2）選擇View> Display Style，選擇Ball and stick以球棍模型顯示。

圖2. 苯分子結構（球棍模型）

法二：手動構建分子結構（以1-丁烯為例）。

（1）選擇File> New>?3D Atomistic，點擊確定。右擊Project Explorer中的文件名3D Atomistic選擇Rename重命名為1-butene。

（2）在工具欄??? 中選擇Sketch Atom> C原子，然后在文檔區域繪制C鏈骨架，并以球棍形式顯示。

圖3. 碳鏈骨架

（3）選中C1-C2鍵，在工具欄??? 中選擇Modify Bond Type>?Double Bond。

圖4. 雙鍵碳骨架

（4）在工具欄? ?選擇Adjust Hydrogen自動添加H原子，在工具欄???選擇Clean調整分子結構，1-丁烯分子構建完畢。

圖5. 1-丁烯

第三步.建立表面模型（以Cu(110)為例）

（1）打開路徑File> Import> Structures> metals > pure-metals> Cu，導入Cu的晶胞（見圖6）。

圖6. Cu晶胞

（2）選擇Build> Surfaces> Cleave Surfaces打開對話框，在（hkl）處輸入要建立的晶面（比如：110），點擊Cleave（注意：表面厚度要大于cut-off distance的值）。

圖7. 切面

(3) 選擇Build> Crystals> Build vacuum slab，點擊Build。（通常設置Vacuum thickness在10?以上）。

圖8. 建立真空層

（4）選擇 Build> Supercell，輸入A 、B 、C的值（如441），得到想要的超晶胞；選擇Build> Bond，點擊Calculate成鍵。

（5）選擇Build> Crystals> Rebuild Crystal，選擇1 P1，點擊Rebuild。以球棍模型顯示，即得到Cu(110)面。

圖9. Cu(110)面

本文由材料人專欄科技顧問供稿。

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