觀點|高效率科研神器——駕馭文獻洪流
【前言】
文獻無疑是目前科研成果的最主要載體。在大家堅持不懈地努力下,現在的文獻是越來越多,大有濤濤江河匯成大海之勢。然而,怎樣才能在大海里暢游而不迷失方向?怎樣才能在海里釣到大魚呢?今天我就來介紹一下我個人的經驗。
【正文】
1. Readcube——最好的文獻管理器
Readcube是近乎完美的文獻管理器,如果沒有墻而你又是付費用戶的話,它會更完美。
獲取地址:https://www.readcube.com/home?r_c=YH1En
文獻管理器是閱讀和管理文獻的核心,因而選擇一款好用的文獻管理器十分重要。目前主流的選擇包括ReadCube, Mendeley和Endnote。根據筆者自己的實際使用體驗,這幾種文獻管理軟件中最好的是Readcube。無論從美觀程度、功能性、平臺覆蓋面上都有碾壓其他軟件的勢頭,缺點是略微有點卡頓。下面我來具體介紹一下它的主要功能和特色。
Enhanced PDF——PDF文件自動識別和強化
目前幾乎所有的文獻都是以PDF格式存在,對PDF文件的處理方式和識別能力直接決定了一款文獻管理軟件的好壞,而ReadCube的殺手锏正是PDF自動識別。
ReadCube主界面
當我們從期刊網站或者課題組主頁上下載了某篇文件的PDF文件之后,通過Readcube的導入按鈕,將文獻拖動到Readcube界面或者直接定位到文獻所在文件夾,就可以將PDF文件批量導入Readcube。一旦導入,Readcube就會自動識別文獻的具體信息。識別成功的文獻會在軟件界面右側顯示文獻的信息,包括期刊、編號、標題、作者、摘要等等。甚至會顯示該文獻的引用量。這樣,你的文獻就不再只是以PDF文件的形式存在,而是以信息完備,分類詳細的數據庫的形式存在。管理將更為方便。你還可以選擇將數據庫中的文獻自動按照作者、發表時間或者標題進行重命名,重新保存到指定文件夾中。
ReadCube導入界面
自動識別成功的文獻信息頁
點擊閱讀按鈕,我們可以打開增強后的PDF文件。文獻中的所有作者姓名和參考文獻的引用上標都變成了可以點擊的狀態,點擊之后,可以直接跳轉到該引用文獻的下載界面或者作者主頁。而右側的一系列選項卡除了提供了參考文獻列表以外,還提供了很多非常有用的功能。比如Metrics選項卡,以圖表形式給出了該文獻的引用數隨時間的變化。下方給出了具體的引用文獻,直接點擊就可以下載。它甚至還能給出其他引用文獻引用該文獻時的具體描述。這一功能簡直是科研工作者做夢都想要的功能。當我們找到一篇我們感興趣的重要文獻時,只需要結合ReadCube提供的引用和被引用文獻列表,就能夠非常迅速的勾勒出一個文獻網絡,一旦在這個網絡中發現其他感興趣的文獻,只需要一次點擊(在你的學校購買了相關數據庫的情況下),ReadCube就能夠自動幫你從學校代理連接到期刊網站,甚至能自動幫你下載好,放入你的數據庫。理想情況下,全程不需要任何額外操作。文獻查找和下載的效率得到了極大的提升。
ReadCube增強后的文獻閱讀界面
點擊PDF文件中的作者名可自動顯示地址和谷歌學術鏈接
點擊文獻中的引用編號可自動顯示對應的文獻信息,點擊卡片即可自動下載該文獻
Metrics選項卡
Files選項卡給出了PDF文件在電腦中儲存的位置,更重要的是,如果該文獻有Supporting Information,即使你沒有下載,Readcube也能夠在這個選項卡中顯示,點擊后就可以直接下載。而Cite選項卡則讓你能夠導出文獻各種格式的引用,方便在Word、PPT等軟件中插入。
Files選項卡
Recommendations——推薦功能
Readcube另一個核心功能是自動化推薦,它能夠根據你文件庫中已有的文獻自動計算出你感興趣的文獻,推薦給你,同樣只需要簡單點擊就可以下載。而且它可以根據你導入文獻時創建的文件夾,針對性地推薦某一特定類別和特定時間段的文獻給你。這樣你就不需要費時費力地到網上檢索了。
ReadCube的文獻推薦功能
All Platforms——全平臺特性
相對于其他文獻管理軟件,Readcube的全平臺同步特性非常強大。它幾乎覆蓋所有平臺,包括Web、PC、Mac、iPad、Android等等。而且在各個平臺上,Readcube的使用體驗幾乎一致,功能性并沒有損失。在網頁版上,Readcube還能夠自動列出文獻中的圖片和圖片標注,方便在閱讀文獻時定位到提及的圖片。
Readcube Web Importor——Chrome插件
Readcube Web Importor是Readcube新出的Chrome插件,付費用戶才能使用。通常,文獻需要將PDF文件下載下來,再導入軟件中才能夠進行管理,這個插件通過在瀏覽器中提供入口,將這一過程進一步簡化。當你打開Google Scholar或者Pubmed的時候,它會在頁面中的每個搜索結果后面直接加上一個按鈕,點擊以后可以直接將結果加入Readcube數據庫。而點擊插件欄上的按鈕,插件將自動識別搜索結果中的文獻,你可以通過勾選你感興趣的結果,將文獻直接批量加入Readcube數據庫中。這樣,你連下載PDF的時間都省了。
谷歌學術搜索結果詞條旁的按鈕
在谷歌學術界面和Pubmed界面可自動識別頁面中的文獻
關于付費功能
Readcube的全平臺同步和Metrics功能是需要購買按年付費的高級版的,高級版還提供一個付費功能是監控特定文件夾,有新文件后自動導入。新用戶可以獲得3個月高級版的免費試用,推薦十個人使用Readcube的話還可以獲得一年高級版。Readcube高級版的正常價格是55美金一年,但是黑色星期五之類的促銷季會打折。至于值不值,各位自己衡量啦。
2. Google圖片——進行直觀的發散式搜索
很少有人會喜歡閱讀滿屏幕的英文,尤其當這些英文中還夾雜著很多字典也查不出來的專業詞匯的時候。但是圖片卻不一樣。優秀的學術文章大多會有簡潔美觀的示意圖。通常情況下,看到這些圖片,你就能夠大致明白文獻的主題。人腦的強大之處在于形象思維和抽象能力。通常情況下,人們更能夠從滿屏幕的圖片而不是滿屏幕的文字中發現相關信息。從這一點出發,我自創了一種快速查找文獻的方法,那就是利用Google圖片。Google圖片搜索的優良算法能夠很好的將相關或者近似領域的搜索結果顯示到一起。而且針對單一圖片,能夠進一步展示類似圖片。并且,相對于其他搜索引擎,我個人感覺,Google給予學術結果的權重更大。
下面我們以Self-assembly為例,來看看怎么利用Google圖片搜索學術資料。
關鍵詞Self-assembly的Google圖片搜索結果
我們可以看到搜索結果基本都是簡潔明了的學術文獻的示意圖。大部分圖片我們不需要看注釋文字就可以大致猜出它要表示的內容。點擊排在前面的一幅圖片,這幅圖片來自nature網站,圖片標題下方給出了圖片的文字描述,我們可以根據描述進一步理解圖片表達的意思。而文字描述下方,Related images給出了類似的其他圖片,我們不需要離開當前頁面就可以進一步查看。而點擊View More,我們就可以查找和當前圖片相關的其他圖片,注意,這時候新的搜索是以圖片為基礎,而不需要輸入關鍵詞,也就是說Google可以根據你感興趣的圖片自動幫你聯想關鍵詞。這樣你就不要煞費腦汁的去思考用什么英文單詞來搜索了。
點擊某一圖片之后出現的圖片具體信息和相關圖片推薦
這一系列看似簡單的功能,實際上使得我們能夠以一兩個關鍵詞為出發點,極其方便的構建一個龐大的搜索網絡,而整個過程中,所有結果都是以圖片形式呈現,你甚至不需要輸入文字,只需要點擊鼠標就行了。你所有的注意力只需要集中到對圖片想要表達意思的抽象判斷上。這無疑讓查找文獻的過程變得極為高效和簡化。
相關插件
搜索結果圖片中,前面的一排方形文字是安裝了Chrome谷歌搜索優化插件之后顯示的關鍵詞進一步精確化的建議,它能將原來網頁搜索結果上方的搜索建議進一步細化,并且以更美觀的形式呈現出來,同時以相同顏色表示相同類別的關鍵詞,方便識別。
安裝了插件之后經過美化的搜索建議
安裝了插件之后經過美化的搜索建議
同時推薦安裝Power Zoom圖片放大插件,按下Ctrl鍵,鼠標移過圖片的同時可顯示該圖片的全尺寸放大圖。
3. 文獻訂閱
自從被Google拋棄之后,RSS訂閱服務似乎漸趨沒落,使用者越來越少。但是由于科研領域的特殊性,RSS在科研領域還是有它的用武之地,尤其是在文獻推薦方面。這里,我介紹兩個新穎的RSS文獻推薦和訂閱服務。
一覽閱讀——新時代的最佳RSS閱讀器之一
一覽閱讀主界面
作為一款本土應用,一覽是一個令人欣慰的存在。它界面簡潔美觀,提供瀑布流式的瀏覽方式。而且它自帶頗為豐富的訂閱源,除了可以訂閱專業學術期刊網站外,還可以訂閱很多泛科學領域的知名網站,如知乎、果殼等。可以說是目前國內RSS閱讀器最好的選擇之一。
SciReader
SciReader主界面
SciReader是專注于學術領域的免費文獻個性化推薦服務。它的主頁面提供三個基本功能,一個是根據你設置的關鍵詞和興趣領域推薦相關的最新文獻給你,可以自動發送到你的郵箱,第二個是在tweeter上討論最多的文獻,第三個是來自Science Daily上的學術新聞。見面美觀簡潔,功能實用,是一個值得考慮的服務。
4. 瀏覽器插件
除了獨立的網站和軟件之外,有一些優秀的瀏覽器插件也能夠給我們的學術生活帶來很大便利。
Wiki2 or Wikiwand
Wiki2和Wikiwand 都是維基百科美化和功能增強插件。維基百科是目前最為龐大的網絡百科全書,儲藏了海量的知識,但是界面卻略顯簡陋。這兩個插件的主要作用是給維基百科穿上漂亮的衣服,同時提供鏈接預覽、頁面收藏等增強功能。兩者的界面風格幾乎是兩個極端。Wikiwand是灰白色調為主的現代風格,提供平板和手機客戶端,而Wiki2非常絢麗多彩,并且,Wiki2在每個維基頁面還集成了Youtube搜索功能,能自動在維基百科頁面中插入相關的Youtube視頻。筆者個人更喜歡Wiki2。蘿卜白菜各有所愛,各位自己選擇一個更順眼的吧。
經過Wiki2美化后的維基百科界面
Wikiwand的網頁和手機界面
Google學術搜索按鈕
這個插件是谷歌公司官方出品的,功能非常實用。當你打開某個期刊的文獻頁面的時候,點擊這個插件的按鈕,它能夠自動顯示頁面中文獻的谷歌學術搜索結果。如果有免費的PDF提供,就會有一個綠色按鈕,點擊即可免費下載文獻,不需要你的學校購買相關的數據庫。點擊引號還可以直接輸出參考文獻的引用,非常方便。
插件在Science上的效果
插件在谷歌學術上的效果
5. 寫在后面
必要的硬件升級
如果你的電腦還用著2G內存和機械硬盤,那么這篇文章其實對你不會有太大幫助。因為相對于優秀軟件帶來的便利,更多的時候,你得忍受令人不悅的卡頓。如果你無法保持一個愉悅的心情,效率的提升就無從談起。我強烈推薦你升級到8G以上內存,并且至少將系統盤換成SSD。即使你的老板很摳門,需要你自己掏這筆錢(500元以內)。
另外,如果你需要經常碼字,我推薦你給自己裝備一個機械鍵盤,它能讓你愛上打字的感覺。如果你是土豪的話,直接上Filco吧。
付費軟件的價值
大部分好的軟件是免費的,但是它們的增值服務是收費的。這也是絕大部分優秀軟件公司的生存方式。中國用戶在使用這些軟件的時候,很少考慮購買增值服務。也有一些即使有購買的意愿,也會受到支付渠道的限制。雖然不是每個人都需要增值服務,但是我希望當你真的需要的時候,不要猶豫。
科學上網
有一點無法否認,那就是目前科技創新和科學研究的第一大國是美國。本文中介紹的很多軟件是美國公司開發的,然而由于眾所周知的原因,某些時候你無法正常的使用這些軟件。尤其在這些軟件中內置了Google的服務的時候。所以備好一把好用的梯子是十分重要的。這樣你就不必在急于訪問一些網站的時候面對打不開的頁面抓狂。
關于梯子的選擇,目前最快最穩定的方式是ShadowSocks,全平臺覆蓋,電腦端可以全局fanqiang,并且速度很快,甚至可以看Youtube高清直播。可惜SS一般需要購買付費賬號,約一兩百一年。如果你有相關的需求,可以考慮購買一個,能夠省去很多煩惱。為了避免廣告嫌疑,這里就不提供相關地址了。至于免費的服務則有很多,然而由于GFW自強不息的技術更新,往往不能長期保持有效,目前最有效的是XX-net和Lantern。
本文轉載自簡書作者青銅紅瓦,鏈接:http://www.jianshu.com/p/6bf14803dc99。
材料牛石小梅編輯整理。
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