科研干貨| Rietveld精修入門
對于X射線多晶衍射數據Rietveld精修來說,大部分材料人并不陌生,但具體的精修方法和注意事項還是有好多人不懂,也被厚重的入門教程繞的云里霧里。今天小編就手把手教大家精修入門,一個完整的流程下來,就再也不會對精修望而生畏了。
第一步:必備軟件
? ? ? CMPR、EXPGUI
第二步:準備數據
儀器參數(.inst文件)、XRD數據(txt格式)、晶體數據(.cif文件).
第三步:精修流程
1.前期準備
(1)將XRD數據的txt格式后綴改為.dat格式(文件夾和數據命名用英文,數據命名不要含括號、下劃線等),無關信息刪除,只剩兩列數據。
(2)打開CMPR軟件,“Read”中選擇“XY data(ascii)”,右側“Directory”中找到準備好的.dat數據,點擊底下的“Read”。(如圖1所示)
(3)“Write”中選中已讀的數據,“Directory”中選擇存放位置,“Fileformat”中選擇“Simple gsas?with esds (.gsas)”;“Values to write”選擇“Original”;最后點擊底部“Write Selected?Datasets”.此時.gsas數據已創建(圖2所示)。
(4)將? .gsas 和? .cif? 、.inst? 數據放在同一個文件夾(記住路徑,并將原始數據備份,以防中途電腦 bug,原始數據丟失)。
2.精修開始
(1)打開EXPGUI軟件,找到存放數據的文件夾,正下方給要精修的數據命名,點擊“Read”,確定并創建新的 .EXP 文件(圖3)。
(2)“Phase”中點擊“Add Phase”,彈出框中點擊選擇“CIF”,打開相應的 .cif 文件,點擊“Add”導入數據(圖4)。
(3)“Powder”中點擊“Add New Histogram”,選擇相應的 .gsas 和 .inst 文件,最下邊選擇“2-Theta Max”,點擊“Add”(圖5)。
(4)“LS Controls”中,“Number of Cycles”一般選擇3,“Extraction method”剛開始精修時選擇“Le Bail method”(圖6)。
(5)“Scaling”下“Scale”后的“Refine”一般不勾選,“Phase Fractions”后的“Refine”可一直勾選運行,所有需要精修的參數它后面的“Damping”一般都選擇5(圖7)。
(6)“Phase”下的“Refine Cell”和“Powder”下的“Background”和“Zero”分別選中,點擊“powpref”,再點擊“genles”精修程序運行,“CHI**2”逐漸減小(圖8)。
(7)待“CHI**2”小于5,“LS Controls”中“Extraction method”選擇“Rietveld”,重復步驟(6),一般“CHI**2”小于2即可,“CHI**2”接近1,wRp小于5的結果比較好(圖9)。
(8)“CHI**2”值較大且基本不變時,可分別選擇“Profile”下的“LX”“LY”“GU”“GV”“GW”進行精修(定量計算時,GU、GV、GW不可精修,因為公式計算會有涉及)。
(9)循環往復至達到滿意的精修結果,Rietveld? 精修結束前,應選中所有可修參數一起精修,至 “CHI**2” 穩定,至此精修部分結束。
第四步:結果導出
1.精修數據導出:點擊“liveplot”彈出精修圖譜,圖譜左上角選擇“File”→“Export plot”→“as.csv?file”,輸出Excel可讀數據,然后用“Origin”軟件等繪制精修圖譜(圖10)。
2.精修后的 cif 文件導出:主界面點擊 “Import/Export”→“CIF Export”→“gsas2cif” ,根據界面提示導出 cif 文件即可(切記:只有在Rietveld結束前全部參數一起精修,才可導出 cif 文件的所有參數)。
3.查看鍵長、鍵角等信息:“Results”→“disagl”→”Save and run DISAGL“,即可在在獨立窗口輸出鍵長、鍵角信息(圖11)。
至此,精修的基本流程就走完啦,要想很好的掌握Rietveld和GSAS精修,僅僅入門還是不夠的,剩下的功能大家就按需學習啦!最后祝大家科研順利。
本文由材料人專欄科技顧問雨田供稿,編輯部整理。
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老師您好,關于儀器參數(.inst文件)和晶體數據(.cif文件)這兩個文件在哪里能獲得呢?求指教