16個小時的零基礎分子動力學入門講授視頻

1月5日6日，材料人舉辦了二維材料分子動力學線下培訓，并錄制了視頻。現在，視頻已經剪輯完畢在材料人APP上上線。

培訓課表

第一節 分子動力學基礎理論
1.1 分子動力學基本原理(分子運動論、勢函數模型)
1.2 分子動力學關鍵技術（力場選擇、時間積分處理、模擬條件控制、數值技巧）
1.3 分子動力學研究流程（軟件選擇、建模、能量最小化、模擬、結果分析

第二節 分子動力學軟件建模基礎
2.1 導入模型、基本操作、導出模型
2.2 由晶體參數構建原胞
2.3 構建超胞、引入缺陷
2.4 建立表面、設置真空層
2.5 草畫分子
2.6 二維材料表面添加指定分子
2.7 構建石墨烯、MXene等典型二維材料模型
2.8 構建石墨烯等二維納米帶模型

第三節 Windows平臺分子動力學模擬實踐
3.1 Windows平臺分子動力學計算流程詳解
3.2 構建各種體系模擬模型(混合模型、界面模型等)
3.3 模擬實踐：石墨烯二維納米孔水分子透過離子過濾模擬

第四節 Linux高性能計算入門+軟件安裝
4.1 Linux（CentOS）系統安裝（物理機或虛擬機）
4.2 WinSCP, XShell遠程軟件安裝配置詳解
4.3 Lammps的Windows版+Linux串行/并行版編譯安裝定制Lammps格式Notepad++編輯器（高亮Lammps文件關鍵詞，讓Lammps文件更清晰易讀）

第五節 Lammps操作基礎+命令詳解
5.1 Lammps計算所需輸入/輸出文件構建和命令詳解（in文件，data文件，lammpstrj 文件結構及格式）
5.2 Lammps計算流程控制（如何自由地高度自定義計算流程及施加各種外界條件）
5.3 Lammps力場勢函數詳解和參數說明（如何針對特定計算體系分析，準確選擇力場）

第六節 Lammps模擬結果后處理/數據分析方法
6.1 體系能量數據分析（原子受力；體系總能、動能、勢能、溫度；特定局部原子group能量、溫度等）
6.2 體系動力學特性分析（均方差位移（MSD），結合Origin軟件計算擴散系數等）
結合例程“二維材料界面離子擴散/離子過濾研究”
6.3 體系結構特征數據分析（結合VMD軟件，進行原子密度分布分析（Density profile），計算徑向分布函數（RDF），學會使用VMD中Tcl語言批量處理分析數據）
6.4 電極/電解質界面雙電層結構，電場分布，電勢分布分析（結合Matlab軟件，學習使用Matlab軟件強大的數據處理和計算功能，學會用Matlab腳本后處理/分析數據）
6.5 電極/電解質界面雙電層比電容計算方法
結合例程“二維材料界面雙電層結構及比電容特性研究”
6.6 二維材料晶格熱導率計算
結合例程“二維材料熱導率計算原理與模擬設計”
6.7 二維材料表面摩擦特性研究
結合例程“二維材料表面摩擦性質計算原理與模擬設計”

培訓講師

余老師，國內985高校博士畢業，現訪學于法國著名材料研究組。余老師曾擔任面向本科生的分子動力學課程講師，以及本科生小組課外科研實踐輔導教師，自2017年起擔任材料人材料計算科技顧問，并擔任分子動力學1對1培訓講師。

自2018年5月起，擔任材料人分子動力學線上訓練營講師至今，已輔導超過200位學員。