想要系統學習LAMMPS分子動力學模擬技術與應用?看這套視頻
收到部分客戶關于系統學習分子動力學模擬的需求,經與科技顧問余老師溝通確定,材料人APP舉辦了一個LAMMPS分子動力學模擬技術與應用線上培訓班。目前,培訓班的所有視頻均已剪輯上線于APP
課程內容
整套內容分為三個獨立的系列課,每個系列課分為上下兩節。
系列課一(上)
**LAMMPS 基礎精解**
結合Lammps in文件中各命令掌握
1. 分子動力學基礎理論
- 1.1 分子動力學基本原理:分子運動論
- 1.2 各種勢函數詳解:做模擬時如何選擇適合自己的勢函數
- 1.3 分子動力學關鍵技術:分子動力學的主要算法介紹,時間積分方法
- 1.4 分子模擬條件和環境的控制:系綜的選擇
- 1.5 分子模擬加速方法:周期性邊界條件,并行計算,GPU加速
- 1.6 分子動力學模擬流程詳解:建模 > 能量最小化 > 模擬 > 結果分析
系列課一(下)
**Linux高性能計算入門 + Lammps軟件定制化安裝**
2. Linux高性能計算入門
- 2.1 Linux(CentOS)系統安裝(物理機或虛擬機)
- 2.2 WinSCP, XShell遠程軟件安裝配置詳解
- 2.3 熟練掌握科學計算常用Linux命令
- 2.4 學習Linux軟件編譯安裝方法,認識makefile文件
- 2.5 掌握在Linux服務器上安裝并行計算軟件openmpi,數學計算庫fftw等
- 2.6 掌握在Linux服務器上安裝Torque Pbs任務管理排隊軟件,科學管理計算任務
3. Lammps軟件定制化安裝
- 3.1 Lammps軟件安裝基本方法介紹
- 3.2 Lammps軟件安裝擴展包介紹-根據自己計算體系進行定制化安裝
- 3.3 并行版Lammps,GPU加速版Lammps編譯安裝方法
實例操作:編譯得到自己的并行版Lammps計算程序
系列課二(上)
**LAMMPS 模擬參數詳解**
- 4.1 Lammps計算所需輸入/輸出文件構建和常用命令詳解(in文件,data文件,lammpstrj 文件結構及格式)
- 4.2 Lammps計算流程控制(如何自由地高度自定義計算流程及施加各種外界條件)
- 4.3 Lammps力場勢函數詳解和參數說明(如何針對特定計算體系分析,準確選擇力場)
- 4.4 Lammps的Windows版+Linux串行/并行版編譯安裝定制Lammps格式Notepad++編輯器(高亮Lammps文件關鍵詞,讓Lammps文件更清晰易讀)
系列課二(下)
**LAMMPS 模擬入門實踐**
- 5.1 結構弛豫
- 5.2 可視化快照
- 5.3 體系能量數據計算(原子受力;體系總能、動能、勢能、溫度;特定局部原子group能量、溫度等)
- 5.4 均方差位移(msd)計算
- 5.5 徑向分布(rdf)計算
- 5.6 擴散系數計算
- 5.7 熱導率計算
實例操作:學員結合自己的研究課題,選擇契合的例子進行模擬
系列課三(上)
**LAMMPS 進階建模**
- 6.1 使用軟件以及Lammps自有命令構建各種體系進階模擬模型(混合溶液模型,固液混合模型,界面模型等)
- 6.2 各種格式結構文件轉化為Lammps要求data文件格式方法
- 6.3 如何尋找力場參數,并導入自己的Lammps in文件
實例操作:學員結合自己的研究課題設計自己的模擬模型,并完成建模
系列課三(下)
**Lammps 進階模擬流程設計及后處理/數據分析方法
7.1 如何設計合理的模擬計算流程,并寫成Lammps in文件
7.2 如何選擇需要計算和導出的相關體系性質
7.3 導出實時模擬結構圖片和動態軌跡
7.4 用Materials Studio,VMD,VESTA等結構顯示軟件做出漂亮的結構圖片和視頻
7.5 體系動力學特性分析(均方差位移(MSD),結合Origin軟件計算擴散系數等)
7.6 體系結構特征數據分析(結合VMD軟件,進行原子密度分布分析(Density profile),計算徑向分布函數(RDF),學會使用VMD中Tcl語言批量處理分析數據)
結合例程:"二維材料界面離子擴散/離子過濾研究"
培訓價格
類別 | 價格 |
系列一 | 499元 |
系列二 | 599元 |
系列三 | 599元 |
全套 | 1499元 |
培訓講師
余老師,國內985高校博士畢業,現訪學于法國著名材料研究組。余老師曾擔任面向本科生的分子動力學課程講師,以及本科生小組課外科研實踐輔導教師,自2017年起擔任材料人材料計算科技顧問,并擔任分子動力學1對1培訓講師。
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