相約11月北京 玩轉二維材料分子動力學

材料人培訓解決方案重磅推出材料計算線上培訓以來，獲得了大量小伙伴的支持。為了更好地讓大家掌握材料計算，材料人特舉辦材料人計算訓練營第九站——北京。

培訓亮點

1.精心設計多個二維材料模擬體系和場景，覆蓋當前多個二維材料理論研究熱點，有助于大家快速掌握并切入自己的研究主題，迅速提高理論研究水平。

2.本次培訓將全程錄像，視頻剪輯后上架材料人APP，學員無需另付費就可獲得視頻觀看權限。

3.課程提供的資料均為電子版，贈送給學員。材料人還為學員準備了專屬U盤。

培訓講師

余老師，國內985高校博士畢業，現訪學于法國著名材料研究組。余老師曾擔任面向本科生的分子動力學課程講師，以及本科生小組課外科研實踐輔導教師，自2017年起擔任材料人材料計算科技顧問，并擔任分子動力學1對1培訓講師。

培訓安排

整個課程耗時三天，培訓流程為：

1：學員報道

11月22日8：30-9：00

2：培訓實踐

11月22-24日 9：00-12:30；13:30-17:30

3：培訓內容
##### 第一天
- **分子動力學方法與理論基礎詳解**
1. 分子動力學理論基礎
- 1.1 常見計算模擬方法淺析：MD、DFT、MC
- 1.2 分子模擬的發展歷史、分子模擬的優勢和局限
- 1.3 分子動力學基本原理：分子運動論，分子動力學的基本假設和理論框架
- 1.4 分子動力學關鍵技術：分子動力學的主要數值算法，時間積分方法及選擇它們的理由
- 1.5 分子模擬條件和環境的控制：系綜的選擇，邊界/截斷/長程作用/系綜/控溫控壓等一系列基本概念介紹
- 1.6 分子動力學模擬流程詳解：建模 > 能量最小化 > 模擬 > 結果分析
- 1.7 各種力場（經驗勢函數）詳解：做模擬時如何針對自己的計算體系選擇合適的勢函數
- 1.8 分子模擬加速方法和高性能計算基礎：周期性邊界條件，并行計算，GPU加速
2. Lammps軟件定制化安裝
- 2.1 Lammps軟件安裝基本方法介紹
- 2.2 Lammps軟件安裝擴展包介紹-根據自己計算體系進行定制化安裝
- 2.3 Linux并行版Lammps，GPU加速版Lammps編譯安裝方法
- 2.4 Windows版Lammps版安裝，實現在Windows系統并行計算
#### `實踐操作：編譯得到自己的并行版Lammps計算程序（Linux版 and Windows版）`
3. 分子動力學軟件初階建模實踐
- 3.1 建模軟件基本操作與界面詳解：導入導出模型，格式轉換等
- 3.2 晶體建模：由晶體參數構建原胞、構建超胞、引入缺陷、建立表面、設置真空層等
- 3.3 非晶體建模：手動草畫分子、異質結晶格匹配、模型拼接與組裝等
- 3.4 復雜模型搭建：溶液（水、離子液體）等固液界面搭建、構建石墨烯、MoS2、MXene等典型二維納米材料模型

##### 第二天
4. Windows平臺分子動力學模擬實踐
- 4.1 常用Windows平臺分子動力學計算流程實踐詳解：建模 > 能量最小化 > 模擬 > 結果分析
#### `實踐操作：構建二維多孔石墨烯/水溶液固液界面模型，并進行二維納米孔分子滲透過濾模擬`
5. LAMMPS 模擬流程與參數詳解
- 5.1 結合分子動力學理論內容詳解LAMMPS模擬流程
- 5.2 學習編寫Lammps計算所需輸入/輸出文件（in文件，data文件，lammpstrj 文件結構及格式）
- 5.3 學習Lammps計算流程控制，實現自定義計算流程及施加各種外界條件
- 5.4 學習Lammps力場勢函數設定，針對特定計算體系分析，準確選擇力場
- 5.5 定制Lammps格式Notepad++編輯器（高亮Lammps文件關鍵詞，讓Lammps文件更清晰易讀）
6. LAMMPS 模擬入門實踐
- 6.1 上機實踐，使用Lammps操作完成結構弛豫，Cu原子晶格參數計算，原子表面摩擦friction、crack等問題的分子動力學模擬
- 6.2 初步掌握分子動力學模擬結果導出和分析：導出軌跡文件，可視化模擬快照及模擬過程視頻
-6.3 分析模擬所得結果，完成體系原子受力；體系總能、動能、勢能、溫度；特定局部原子group能量、溫度等數據計算
- #### `實例操作：Cu原子晶格參數、總能計算模擬與初步數據處理`
7. 分子動力學軟件進階建模實踐
- 7.1 學會使用多種建模軟件和方法：Packmol、Motenplate VMD topotool以及Lammps自有命令
- 7.2 掌握各種進階模擬模型構建方法(二維納米片層、管/三維晶體、非晶，有機、無機混合溶液模型，固液混合模型，界面模型等)
- 7.3 掌握各種格式結構（pdb、car、xyz等）文件轉化為Lammps規定data文件格式方法
- 7.4 學會使用Ovito，VMD，VESTA等結構顯示軟件做出漂亮的結構圖片和視頻
- #### `實例操作：指導各學員結合自己的研究課題設計自己的模擬模型，并完成建模`

##### 第三天
8. LAMMPS 模擬進階實踐-二維材料模擬設計專題
- 8.1 二維材料表面摩擦特性研究與AFM原子力顯微鏡的原子級模擬-模擬設計
- #### `實例操作：“AFM原子級模擬與二維材料表面摩擦性質模擬設計”`
- 8.2 二維材料晶格熱導率計算-模擬設計
- #### `實例操作：二維材料熱導率計算原理與模擬設計”`
- 8.3 二維材料海外淡化過濾滲透-模擬設計
- #### `實例操作：多孔石墨烯、MoS2海外淡化過濾滲透-模擬設計”`
- 8.4 粒子材料轟擊塊材或原子在二維材料表面沉積模擬
- #### `實例操作：B原子轟擊石墨烯表面模擬與缺陷分析”`
- 8.5 二維材料的拉伸形變及伴隨力學特性分析-模擬設計
- #### `實例操作：石墨烯拉伸形變及伴隨力學特性分析-模擬設計”`
9. Lammps 進階模擬流程設計
- 9.1 如何設計合理的模擬計算流程，并寫成Lammps in文件
- 9.2 如何選擇需要計算和導出的相關體系性質
- 9.3 導出實時模擬結構圖片和動態軌跡
10. 進階后處理/數據分析方法
- 10.1 體系動力學特性分析（均方差位移（MSD），結合Origin軟件計算擴散系數等）
- 10.2 體系結構特征數據分析（結合VMD軟件，進行原子密度分布分析（Density profile），計算徑向分布函數（RDF），學會使用VMD中Tcl語言批量處理分析數據）
- #### `實踐操作："二維材料電極/電解質界面溶液雙電層模擬設計"`

注：本次培訓需自備筆記本，培訓將提供測試賬號體驗。

培訓費用及發票

注1：本次培訓由材料人旗下北京紫荊高科科技有限公司開具電子發票或紙質發票

注2：本次培訓費用不包含食宿和交通費，請自行解決。

注3：材料人往期線下培訓學員報名享受團報價。

注4：享受早鳥價需要在截至日前款項到賬。

培訓地點

北京市海淀區學院橋科大天工大廈B座3層會議區

報名咨詢

請添加客服微信maxw89。

繳費方式

2：如使用公務卡，可在材料人APP內購買相應課程或技術培訓解決方案。

3：咨詢客服先辦理開票后對公轉賬

請確保款項在開課前到賬。

報名截止日期

2019年11月20日

其他聯系方式

電話：010-82810279