復旦大學Macromolecules: 樹枝形鏈的喚醒動態性質:一種圖論算法
【引言】
樹枝形分子是一類通過內部反應合成的具有特定結構的大分子,因為它具有廣泛的應用前景,比如在傳感器、催化劑、生物醫藥等領域的應用,一直以來研究人員對它進行了深入的研究,特別是對它的靜態(旋轉半徑、靜態結構因素等)和動態(黏度、弛豫譜等)性質,進行了大量而深入的理論研究。盡管對這種分子的動態性質做了大量的研究,但是,利用計算機對它進行動態模擬分析,還是鮮有報道。而且少量報道的文獻,也僅僅是聚焦在它的靜態性質的模擬,而動態性質的模擬報道非常少。
【成果簡介】
近日,復旦大學的楊玉良教授(通訊作者)等人利用圖論算法,對樹枝形分子的動態性質進行了模擬分析,得到了G代樹枝狀鏈喚醒矩陣的特征多項式,而且這種鏈為任意間隔長度(n),掌握了其內部函數(f0)和外層函數(f)。而且,利用系數與特征多項式根的關系,得到了任意 f 和f0與環旋半徑關系的準確表達式。而且,以沒有間隔長度(也就是f0=f,n=0)的標準樹形分子為案例分析,得到了其近似特征值,該特征值與數值結果完全一致。基于得到的特征值,計算了這一類樹枝形分子的動態性質,即內在存儲模量G’(ω)和損耗模量G’’(ω),而且還與線形鏈分子和星形鏈分子的模量進行了比較分析。相關成果以“ The Rouse Dynamic Properties of Dendritic Chains: A Graph Theoretical Method”為題,發表在近期的Macromolecules雜志上。
【圖文導讀】
圖1 樹枝形分子的結構
(a)樹枝形分子結構圖,ΓG,f0,f(x),G=5,內段株(灰色圓)函數f0=3,所有的外層株(空心圓)函數f=3,圖中沒有明確標明株之間的間隔;
(b)樹枝狀分子鏈的參數分別f0=1,2,4。
圖2 對圖1中的Γ5,3,3進行連續旋轉操作后所得到的子圖
(a)第一次旋轉操作后得到的子圖;
(b)第二次旋轉操作后得到的子圖;
(c)進行連續的旋轉操作,直到子圖全都變成線形鏈。
(子圖的更多細節,請參考圖3。)
圖3 圖2線形子圖中子單元所對應的特征多項式及其示意圖
根據楊氏規則,不同株的質量因素須要考慮,也就是小圓圈表示質量因素為x的間隔株,黑點表示最后一代質量因素為x-1的株,大圓圈表示質量分數為x + f-2大分支株;中間株質量因素為x + f0-2,用灰色圓圈表示;另外,每個沒有標示的鍵,其質量因素為-1,為了說明清楚,圖中沒有畫出來。
圖4 G~<S2>/n關系圖和G~r關系圖
(a)G與旋轉半徑<S2>/n的關系圖,n=20,f=3,改變f0。需要指出的是,當f0=100時,旋轉半徑與f0=3時的旋轉半徑相比,稍微大一點點。插圖是n=0,f=3時,G與<S2>的關系曲線;
(b)n=20,f=3,f0分別為1,2,3,4,6,8,20時,G與r的關系圖。
圖5 不同f下,G與旋轉半徑<S2>/n的關系圖
其中,間隔長度n=20。
圖6 f=3,n=2時,G與<S2>的關系圖
從圖中可以看出,僅當G至少大于20時,曲線才接近漸近線<S2>=nG(紅色線);樹枝鏈的f0=1時,在G為2~10的范圍內,曲線幾乎為<S2>=G2。
圖7 以n=0,f=f0=3為案例,近似非退化特征值與數值結果的比較
灰色列數據為文獻值,白色列數據為計算值。
圖8 以n=0,f=f0=3為案例,近似退化特征值與數值結果的比較
G下的列數據表示其左列數據對應的退化特征值,空白表示其對應的第二列中的數值不是G的特征值;第一列數據是數值求解得到的數據,第二列數據是解析求解得到的數據。
圖9 G’和G’’分別與ωτ1的關系圖
圖10 G’和G’’分別與ωτ1的關系對比圖(樹枝形分子與線形分子和星形分子對比)
G=6時,線形鏈和星形鏈上的株數量與標準樹枝形鏈上的株數量相等。
圖11?δ ~ωτ1關系圖
G=6時,線形鏈和星形鏈上的株數量與標準樹枝形鏈上的株數量相等。
圖12 Pn(x)和PL(n-2)(x)的簡化圖
【小結】
1、利用圖論算法,對樹形分子進行了動態分析,通過內部株函數f0和外層株函數f以及間隔長度n和模量G,得到了特征多項式;進一步利用系數與特征多項式的根的關系,得到了任意 f 和f0與環旋半徑關系的準確表達式;
2、以沒有間隔長度(也就是f0=f,n=0)的標準樹形分子為案例,利用圖論算法對其進行案例分析,得到了近似特征值,且其與數值結果完全一致;
3、基于得到的特征值,計算了這一類樹枝形分子的動態性質,即內在存儲模量G’(ω)和損耗模量G’’(ω),而且與線形鏈分子和星形鏈分子的模量進行了比較;
4、通過與傳統圖論方法相比較,證明了該圖論方法簡潔、高效,而且具有極強的適用性。
文獻鏈接:The Rouse Dynamic Properties of Dendritic Chains: A Graph Theoretical Method(Macromolecules, 2017, DOI: 10.1021/acs.macromol. 7b00040)
本文由材料人編輯部高分子小組熊文杰提供,材料牛編輯整理。
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