Michele Parrinello近期PRL:深度學習MetaD方法研究硅的液態結構和晶體形核
【引言】
硅是一種在基礎研究和工業應用中都很重要的元素,固態硅是四價的半導體,而由于共價鍵的存在,在結構松散排布的時候會形成金屬液體,這種共價鍵和金屬鍵相互競爭的行為很難用有效的勢函數來模擬,因此研究硅的結晶過程仍是一個極具挑戰性的課題。ab initio分子動力學方法提出之初, Car-Parrinello方法的發展有助于深入研究熔化機制,可以表示液體是如何進行成鍵和斷鍵從而引發異常行為。此后,很多研究都是針對固態和液態硅的性質展開的。從第一性原理角度出發描述硅的結晶行為仍然是一個重要挑戰。
【成果簡介】
近日,瑞士蘇黎世聯邦理工學院(ETH Zürich)、新材料計算設計研發國家中心的Michele Parrinello教授(通訊作者)在Physical Review Letters上發表最新研究成果“Silicon Liquid Structure and Crystal Nucleation from Ab Initio Deep Metadynamics”。形核是小概率事件,時間尺度遠大于ab initio分子動力學可達到的程度。為解決這一問題,作者基于使用經典勢函數進行MetaD(metadynamics)所生成的一系列數據,訓練了一個深度學習網絡勢函數,文中對如何有效地為感興趣的過程收集相關數據作了說明。為有效率地驅動結晶過程,作者引入了一種基于Debye結構因子的集體變量,從而將長程序信息編碼進局域變量,局域變量更適合用來描述形核動力學。此外,為更好地描述硅相圖中的復雜成鍵形式,作者選用SCAN交換關聯函數來計算參考能量值。最后,該工作在密度泛函理論和實驗數據的精度上重現了自由能表面。作者還研究了形核過程的早期階段,揭示了形核機制的特征。
【圖文導讀】
圖1:液相和固相的局域結構因子Si(q1)分布。內插圖為截斷半徑為8?的Debye結構因子。
圖2:溫度為1700K時,MetaD模擬得到的構型分布隨結構因子第一峰強度變化的函數關系。
圖3:在熔點附近的不同溫度下,Gibbs自由能隨結構因子第一峰強度變化的函數關系。
圖4:使用DeePMD勢函數在1700K進行MetaD模擬所得最大團簇的快照。
【小結】
此篇工作中,呈現了如何使用MetaD這一有效工具來選取相關構型訓練基于神經網絡的勢函數,來研究小概率事件。這一方法可應用于凝聚態體系,也可用于反應事件和生物物理系統中,后者的訓練集可能更難設計,需要更為標準的方法。此外,文章呈現了如何將結構因子給定的長程序信息編碼進局域變量,用于有效率地驅動形核過程,這為研究溶液中形核行為提供了一個極具潛力的方案。
文獻鏈接:Silicon Liquid Structure and Crystal Nucleation from Ab Initio Deep Metadynamics(Phys. Rev. Lett.,2018,DOI:10.1103/PhysRevLett.121.265701)
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