測試干貨|核磁共振好基友MestReNova—手把手教你做出一張核磁譜圖
核磁共振(NMR,Nuclear Magnetic Resonance)是基于原子尺度的量子磁物理性質。具有奇數質子或中子的核子,具有內在的性質:核自旋,自旋角動量。核自旋產生磁矩。NMR觀測原子的方法,是將樣品置于外加強大的磁場下,現代的儀器通常采用低溫超導磁鐵。核自旋本身的磁場,在外加磁場下重新排列,大多數核自旋會處于低能態。我們額外施加電磁場來干涉低能態的核自旋轉向高能態,再回到平衡態便會釋放出射頻,這就是NMR訊號。利用這樣的過程,可以進行分子科學的研究,如分子結構、動態等。
在對核磁進行分析的時候,小伙伴們一定離不開MestReNova這個基礎軟件。簡單的分析想必大家都會,可是如果是要放在文章里的話,可能就需要下一番功夫了。今天小編帶領各位看官一起做一張可以放在文章中的核磁譜圖。(多圖預警)
第一步:定標
要分析核磁圖,首先要先會打開它(以小編做的一個材料為例,溶劑為CDCl3)。打開文件夾,選擇任意一個文件(以acqus為例)后選擇用MestReNova打開。我們最常用的就是下圖中紅色框內的幾個按鈕了。
打開之后的軟件界面如下圖。
首先用下圖中紅框按鈕對想著重觀察的區域放大,一般情況下我們首先觀察芳香區,也就是化學位移在7左右的區域。
用紅框中的鍵對溶劑峰定標(選擇7.26附近的峰,將ppm值改為7.26)
第二步:標峰
選擇圖中紅框圖標,采用人工標峰。框選出你要標的峰,然后松手。
峰的化學位移值如下圖所示。烷基區同上。
第三步:積分
選擇圖中紅框選中按鈕選擇人工積分。標定之后如圖中所示。
第四步:標定偶極矩
選擇圖中紅框選中按鈕,選擇“Automatic”。
電腦就會自動對已經已經積分的部分進行計算。結果如下圖所示。
一般來說,文章正文中不會出現核磁譜圖,核磁譜圖通常會放在supporting information里,文章正文中通常放文字。那么怎么將核磁圖轉化為文字呢?不要著急 ,且聽我一一道來。
點選“Report”,在圖表中就會出現核磁的文字分析結果。
選中之后,就可以直接黏貼在你的正文中了(別忘了刪除框框哦)。
第五步:修飾、美化
分析正確之后,如果直接把這樣的譜圖放在文章里,總覺得和白花花的背景有些維和,為了讓圖譜看的更加和諧,我們就需要對其進行美化。
選擇圖中紅框的“小手”,然后在空白處雙擊左鍵。
選擇右邊第2個選項卡,按圖中所示,勾選掉3中的兩個對鉤,這樣圖譜中背景就會變成空白。
勾選掉“Vertical”,這樣圖譜中的縱坐標就沒有了。
選擇第3個選項卡,如圖所示,選擇合適的字體字號等。
選擇第4個選項卡,如圖所示,將“Curve”勾選掉,去掉曲線;將2%改為3%,將積分上移。
最后選擇“OK”這樣你就得到了一張漂亮的核磁圖了。
為了使圖形在放大縮小時不失真,我們需要把圖形保存為矢量圖。
選擇File,save as,將保存類型設為tiff,保存為矢量圖。
這樣,一張可以放到文章中的標準NMR圖就出爐了!
總結:
總體流程就是:定標、標峰、積分、標定偶極矩、美化。
如果能結合著Chemdraw,將化學分子式貼入核磁譜圖中
少年,發Nature就指日可待了!
(Chemdraw使用教程參看學術干貨|化工材料學子基礎入門必備–ChemDraw的使用方法)
本文由材料人編輯部學術干貨組 大宋、高駿?供稿,材料牛編輯整理。
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